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# Microbiote intestinal et réponse aux médicaments

Les bactéries de l'intestin peuvent activer les médicaments, les inactiver ou les rendre plus toxiques, ce qui explique en partie les différences de réponse.

Mis à jour 1 nov 2026

L'intestin abrite une immense communauté de microbes dotés de leurs propres enzymes. Les médicaments oraux, et ceux qui reviennent dans l'intestin par la bile, rencontrent ces enzymes avant ou après l'absorption. Les bactéries peuvent activer des prodrogues, inactiver des médicaments, défaire la conjugaison hépatique et modifier indirectement le métabolisme de l'hôte. Les antibiotiques, l'alimentation et les maladies modifient le microbiote, et donc la réponse aux médicaments.

## L'essentiel

- Activation: les bactéries intestinales scindent la sulfasalazine en sulfapyridine et en acide 5-aminosalicylique, la partie qui agit sur le côlon.
- Inactivation: certaines souches d'Eggerthella lenta réduisent la digoxine en produits inactifs; la notice de la digoxine indique que chez environ un patient sur dix, les bactéries coliques dégradent une grande partie de la dose.
- Les antibiotiques peuvent modifier cela: la notice de la digoxine cite la clarithromycine comme augmentant l'absorption de la digoxine chez les patients dont les bactéries intestinales l'inactivent.
- Réactivation: des enzymes bactériennes peuvent défaire la glucuronoconjugaison hépatique et libérer dans l'intestin un médicament actif ou toxique, comme décrit pour l'irinotécan et les AINS.
- Le cycle entérohépatique (conjugué dans la bile, libéré par les bactéries, réabsorbé) peut prolonger l'action d'un médicament.

## Comment les microbes modifient les médicaments

- Réduction (par exemple des liaisons azo ou du cycle lactone de la digoxine)
- Hydrolyse et déconjugaison (bêta-glucuronidases bactériennes)
- Décarboxylation: une tyrosine décarboxylase bactérienne (chez Enterococcus faecalis) peut transformer la lévodopa en dopamine dans l'intestin, avant qu'elle n'atteigne le cerveau (données préliminaires)
- Effets indirects: des produits microbiens comme les acides biliaires agissent sur des récepteurs de l'hôte qui contrôlent les enzymes du métabolisme des médicaments

## Digoxine et Eggerthella lenta

Certaines souches d'E. lenta réduisent la digoxine en dihydrodigoxine, qui est inactive. Une revue de 2021 parue dans Clinical Pharmacokinetics relie ce phénomène à un groupe de gènes de réductase des glycosides cardiotoniques, activé par la digoxine uniquement chez ces souches. Comme tout le monde ne porte pas ces souches, c'est un modèle de la façon dont les gènes humains et microbiens façonnent ensemble le taux d'un médicament.

## Cycle entérohépatique et toxicité

Le foie fixe un glucuronide sur de nombreux médicaments et les envoie dans la bile. Dans l'intestin, des enzymes bactériennes peuvent retirer ce groupement: le médicament est alors réabsorbé (recyclage) ou sa forme active lèse la muqueuse intestinale. La même revue décrit ce phénomène pour l'anticancéreux irinotécan (son glucuronide inactif est retransformé dans l'intestin en métabolite actif SN-38, ce qui peut aggraver la diarrhée) et pour les AINS (surtout des données animales), ainsi que l'influence du microbiote sur les inhibiteurs de points de contrôle immunitaire.

## Pourquoi c'est important en pratique

Commencer ou arrêter des antibiotiques, un changement d'alimentation, une chirurgie intestinale ou une diarrhée peuvent modifier l'effet des médicaments qui dépendent des bactéries intestinales. Le domaine est encore jeune: pour la plupart des médicaments, il n'existe pas de test de routine, mais le mécanisme justifie de réévaluer taux et effet après de grands changements de la flore intestinale.

## Moyen mnémotechnique

Les bactéries intestinales peuvent allumer les médicaments (sulfasalazine), les éteindre (digoxine) ou les rallumer (retrait du glucuronide).

## Testez-vous

Réfléchissez à la réponse, puis touchez la question pour la voir.

## Quelle partie de la sulfasalazine est libérée par les bactéries intestinales et agit sur le côlon?

L'acide 5-aminosalicylique; les bactéries scindent la sulfasalazine en sulfapyridine et en acide 5-aminosalicylique.

## Pourquoi un antibiotique peut-il augmenter les taux de digoxine chez certains patients?

Chez les patients dont les bactéries intestinales inactivent la digoxine, un antibiotique peut réduire ces bactéries, si bien que davantage de digoxine est absorbée intacte.

## Que font les bêta-glucuronidases bactériennes aux conjugués de médicaments dans l'intestin?

Elles retirent le glucuronide fixé par le foie et libèrent le médicament, qui peut alors être réabsorbé ou léser la muqueuse intestinale.

## Classes liées

- [Glycosides cardiotoniques](https://durgical.com/fr/pharmacologie/classes/glycosides-cardiotoniques/)
- [Anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS)](https://durgical.com/fr/pharmacologie/classes/anti-inflammatoires-non-steroidiens/)

## Exemples de médicaments

- [Digoxine](https://durgical.com/fr/pharmacologie/digoxine/)
- [Sulfasalazine](https://durgical.com/fr/pharmacologie/sulfasalazine/)
- [Irinotécan](https://durgical.com/fr/pharmacologie/irinotecan/)
- [Lévodopa + carbidopa](https://durgical.com/fr/pharmacologie/levodopa-carbidopa/)
- [Clarithromycine](https://durgical.com/fr/pharmacologie/clarithromycine/)

[← Toute la pharmacologie](https://durgical.com/fr/pharmacologie/)

Contenu pédagogique sur le mode d'action des médicaments; ce n'est pas un guide de prescription et il ne remplace pas l'avis d'un professionnel de santé. Aucune posologie n'est indiquée.

Sources: [Contribution of the Gut Microbiome to Drug Disposition, Pharmacokinetic and Pharmacodynamic Variability](https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8332605/) (Clinical Pharmacokinetics (open access, PubMed Central), 2021); [DailyMed - DIGOXIN tablet](https://dailymed.nlm.nih.gov/dailymed/drugInfo.cfm?setid=f3d29508-e7cc-47ff-845d-b5375ee30407) (DailyMed (U.S. National Library of Medicine), 2026); [DailyMed - SULFASALAZINE tablet](https://dailymed.nlm.nih.gov/dailymed/drugInfo.cfm?setid=88441a9f-b4f9-455d-a355-46fb30699a7b) (DailyMed (U.S. National Library of Medicine), 2026).

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